Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms