Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sbno1Q689Z5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno1Q689Z5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms