Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20854Q62461 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20854Q62461 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20854Q62461 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20854Q62461 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm20854Q62461 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20854Q62461 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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