Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sall3Q62255 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sall3Q62255 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms