Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh1a2Q62148 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh1a2Q62148 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms