Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gli3Q61602 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gli3Q61602 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms