Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OclnQ61146 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OclnQ61146 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms