Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc1Q61056 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trpc1Q61056 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Trpc1Q61056 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc1Q61056 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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