Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TmpoQ61033 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TmpoQ61033 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms