Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp7Q60973 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp7Q60973 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms