Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelnQ60841 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelnQ60841 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RelnQ60841 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RelnQ60841 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RelnQ60841 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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RelnQ60841 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RelnQ60841 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms