Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot7Q60809 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Cnot7Q60809 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Cnot7Q60809 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot7Q60809 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms