Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms