Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mkrn3Q60764 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mkrn3Q60764 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms