Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samhd1Q60710 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samhd1Q60710 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms