Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SkiQ60698 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SkiQ60698 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms