Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PmelQ60696 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmelQ60696 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms