Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sik1Q60670 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sik1Q60670 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms