Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3aQ60520 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms