Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q5XFZ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q5XFZ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms