Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gprasp1Q5U4C1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gprasp1Q5U4C1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms