Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Brip1Q5SXJ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brip1Q5SXJ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms