Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Myh1Q5SX40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms