Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsr1Q5SWD9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms