Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms