Protein–RNA interactions for Protein: Q5SU73

Coil, Coilin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoilQ5SU73 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CoilQ5SU73 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CoilQ5SU73 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms