Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms