Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TefmQ5SSK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms