Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Gm11487Q5RIS0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm11487Q5RIS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm11487Q5RIS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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