Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trim41Q5NCC3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms