Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm12253Q5NC48 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm12253Q5NC48 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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