Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vps41Q5KU39 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms