Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hs3st6Q5GFD5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms