Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trpm3Q5F4S9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm3Q5F4S9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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