Protein–RNA interactions for Protein: Q5F226

Fat2, Protocadherin Fat 2, mousemouse

Predictions only

Length 4,351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat2Q5F226 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fat2Q5F226 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fat2Q5F226 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Fat2Q5F226 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Fat2Q5F226 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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