Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpjQ569L8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms