Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spire1Q52KF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms