Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opa3Q505D7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms