Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox3aQ4TU90 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox3aQ4TU90 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms