Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem171Q4KL18 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem171Q4KL18 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms