Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tmem40Q4FJU9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem40Q4FJU9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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