Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5aQ3UXZ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm5aQ3UXZ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms