Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn13Q3UW68 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn13Q3UW68 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms