Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate2Q3UW31 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms