Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chpf2Q3UU43 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms