Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm10Q3UTQ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm10Q3UTQ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms