Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms