Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain3Q3URJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms