Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms