Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms